Bonjour,
Perso, je supprimerais les cerises pourries. En tout cas il faut les ramasser.
Il se pourrait que votre cerisier soit touché par le monilia ou moniliose, qui forme des cercles concentriques sur les fruits qui pourrissent sur place.
Regardez sur le net comment traiter en prévention pour éviter cette maladie. J’ignore s’il existe des traitements acceptés en culture bio.
Doris